13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1250 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1250  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  303  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.164225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0948  hypothetical protein  76.19 
 
 		 147 aa  248  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000163038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  90.8 
 
 		 217 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0416  hypothetical protein  51.4 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2036  hypothetical protein  37.93 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1581  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0754175  normal  0.248809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1411  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1150  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4430  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.63316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  36.25 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  24 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0712  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>