19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6344 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6344  IS4 family transposase  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2933  transposase  88 
 
 		 301 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3286  transposase  41.89 
 
 		 411 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5767  transposase  40.54 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2443  IS4 family transposase  37.5 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.354426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1744  transposase IS4 family protein  38.67 
 
 		 415 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4479  putative transposase of IS4 family insertion sequence ISY391c  35.06 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0252  FOG: transposase-like protein  35.06 
 
 		 368 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4538  FOG: transposase-like protein  35.06 
 
 		 368 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1782  FOG: transposase-like protein  35.06 
 
 		 368 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3952  transposase IS4 family protein  31.08 
 
 		 426 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  37.11 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 412 aa  43.5  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 412 aa  43.5  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 412 aa  43.5  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1937  hypothetical protein  37.97 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  38.46 
 
 		 399 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  38.46 
 
 		 399 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  40.79 
 
 		 445 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>