30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6174 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6174  thiamineS protein  100 
 
 		 84 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  64.29 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  57.32 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  57.14 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.95 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  48.31 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  49.4 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8251  thiamineS protein  56.25 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  52.38 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  49.38 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  50.63 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  47.62 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  47.62 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  47.62 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  46.43 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  41.11 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  37.23 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4375  thiamineS protein  50.59 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.38 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  47.62 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  45.12 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  37.21 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1243  hypothetical protein  38.82 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00015012  normal  0.456438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  47.62 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  46.43 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  46.43 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0645  MoaD family protein  33.33 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0291905  normal  0.265386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  43.21 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  39.76 
 
 		 103 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  36.14 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>