29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5672 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  66.39 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  36.44 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  40.71 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  38.94 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  38.39 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  39.47 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  39.47 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  45.92 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  39.47 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  40.35 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  38.53 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  37.86 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  33.93 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  49.25 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  45.1 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  39.47 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  39.36 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  41.18 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  40.57 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  56.52 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  32.5 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  51.72 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  40.4 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  39.05 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0231  hypothetical protein  48.89 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  42.19 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  30.91 
 
 		 139 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>