18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5267 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  100 
 
 		 178 aa  331  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  71.75 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  38.69 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  43.45 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  38.41 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  46.05 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  35.25 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  41.82 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  34.65 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  34.44 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  38.18 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  31.78 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  38.57 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  33.93 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  39.71 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>