29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4905 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  271  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  45.04 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  47.1 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  47.1 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  47.1 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  47.11 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  43.8 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  45.45 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  38.53 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  40.15 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  38.35 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  38.89 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  39.5 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  47.37 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  45.1 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  38.32 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  36.54 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  34.43 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  34 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  34.69 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  39.47 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  48.39 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  47.95 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  31.01 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  35.62 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  38.18 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2433  hypothetical protein  34.51 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0955395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1988  hypothetical protein  34.69 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>