25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3658 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0131  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  31.95 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  28.88 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  27.41 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  32.26 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  33.87 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  30.49 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  26.38 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 206 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42851  predicted protein  39.19 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.273956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>