16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3596 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3596  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25730  integrase family protein  59.09 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13668  transposase  50 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0360997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12957  transposase  53.19 
 
 		 413 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2579  Integrase catalytic region  45.45 
 
 		 428 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  51.02 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  51.02 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  51.02 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  51.02 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  51.02 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  51.02 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  46.43 
 
 		 430 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  50 
 
 		 408 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  57.14 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  57.14 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  52.08 
 
 		 405 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>