23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0831 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0831  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3899  hypothetical protein  67.96 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3943  hypothetical protein  59.67 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4017  hypothetical protein  59.67 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3957  hypothetical protein  59.67 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.391293  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4415  hypothetical protein  58.48 
 
 		 183 aa  194  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.934366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2226  hypothetical protein  59.89 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11291  hypothetical protein  54.95 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000669706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0946  hypothetical protein  58.33 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0730  hypothetical protein  54.49 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4443  hypothetical protein  61.01 
 
 		 188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0707  hypothetical protein  58.49 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.915433  normal  0.0707111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1073  hypothetical protein  59.28 
 
 		 170 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8531  hypothetical protein  56.52 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1101  hypothetical protein  36 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000016609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.63 
 
 		 292 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.61 
 
 		 292 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.35 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  27.35 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.61 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  27.35 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.35 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.35 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>