15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4415 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4415  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  358  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.934366  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0730  hypothetical protein  61.99 
 
 
192 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3899  hypothetical protein  58.7 
 
 
183 aa  207  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11291  hypothetical protein  60.71 
 
 
226 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000669706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0831  hypothetical protein  60.23 
 
 
176 aa  197  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3943  hypothetical protein  61.05 
 
 
203 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4017  hypothetical protein  61.05 
 
 
203 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3957  hypothetical protein  61.05 
 
 
203 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.391293  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0707  hypothetical protein  59.01 
 
 
187 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.915433  normal  0.0707111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2226  hypothetical protein  58.56 
 
 
176 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0946  hypothetical protein  62.21 
 
 
207 aa  185  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4443  hypothetical protein  58.54 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1073  hypothetical protein  61.68 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8531  hypothetical protein  60.37 
 
 
175 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00669889  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1101  hypothetical protein  37.91 
 
 
170 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000016609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>