23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4539 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4539  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7331  hypothetical protein  89.32 
 
 		 212 aa  390  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4974  hypothetical protein  73.66 
 
 		 205 aa  318  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3580  hypothetical protein  74.63 
 
 		 205 aa  315  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9378  hypothetical protein  74.27 
 
 		 206 aa  309  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.744975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5100  hypothetical protein  64.79 
 
 		 221 aa  295  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.333  hitchhiker  0.000000366045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4582  hypothetical protein  64.42 
 
 		 218 aa  289  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466428  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  67.98 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7089  hypothetical protein  63.82 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.670641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39700  acetyltransferase (GNAT) family protein  55.38 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4505  hypothetical protein  57.89 
 
 		 244 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4689  GCN5-related N-acetyltransferase  52.28 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.969792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6428  GCN5-related N-acetyltransferase  50.98 
 
 		 204 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5404  hypothetical protein  40.66 
 
 		 269 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13951  hypothetical protein  39.26 
 
 		 244 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5405  hypothetical protein  39.57 
 
 		 249 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5781  hypothetical protein  39.57 
 
 		 249 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5494  hypothetical protein  39.57 
 
 		 249 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4235  hypothetical protein  42.54 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0836  hypothetical protein  38.46 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.485389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6070  hypothetical protein  37.87 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  0.16061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4856  hypothetical protein  37.3 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.815619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>