39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4401 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  100 
 
 		 837 aa  1578    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  66.48 
 
 		 876 aa  1003    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  43.99 
 
 		 790 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  40.12 
 
 		 751 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  41.74 
 
 		 747 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  40.78 
 
 		 857 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  39.78 
 
 		 789 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  40.42 
 
 		 789 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  39.53 
 
 		 761 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  35.98 
 
 		 820 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  38.12 
 
 		 764 aa  354  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  38 
 
 		 764 aa  353  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  36.48 
 
 		 752 aa  352  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  38.06 
 
 		 739 aa  350  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  37.69 
 
 		 820 aa  344  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  37.03 
 
 		 751 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  36 
 
 		 756 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  35.5 
 
 		 748 aa  324  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  37.32 
 
 		 758 aa  323  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  33.73 
 
 		 777 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  35.13 
 
 		 758 aa  317  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  35.06 
 
 		 759 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  35.64 
 
 		 726 aa  296  7e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  32.99 
 
 		 834 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  32.1 
 
 		 826 aa  266  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  41.52 
 
 		 953 aa  266  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  46.31 
 
 		 745 aa  238  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  35.03 
 
 		 762 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  34.58 
 
 		 798 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  30.01 
 
 		 840 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  28.37 
 
 		 822 aa  173  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  32.12 
 
 		 779 aa  171  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  30.49 
 
 		 856 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  30.69 
 
 		 719 aa  150  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  44.35 
 
 		 817 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 545 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0970  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.14 
 
 		 230 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  21.74 
 
 		 557 aa  47.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  31.01 
 
 		 554 aa  47.8  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>