37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3427 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  100 
 
 		 840 aa  1644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  43.72 
 
 		 856 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  30.35 
 
 		 798 aa  220  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  31.43 
 
 		 752 aa  190  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  28.92 
 
 		 876 aa  185  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  30.13 
 
 		 837 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  30.28 
 
 		 751 aa  181  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  30.86 
 
 		 857 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  30.54 
 
 		 790 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  28.81 
 
 		 759 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  29.92 
 
 		 820 aa  170  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  28.45 
 
 		 789 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  29.39 
 
 		 758 aa  154  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  29.51 
 
 		 761 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  28.52 
 
 		 751 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  32.96 
 
 		 953 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  26.46 
 
 		 777 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  28.85 
 
 		 747 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  29.75 
 
 		 756 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  28.11 
 
 		 764 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  27.89 
 
 		 764 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  30.96 
 
 		 822 aa  132  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  27.9 
 
 		 739 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  30.59 
 
 		 748 aa  131  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  29.98 
 
 		 789 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  35.58 
 
 		 758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  29.58 
 
 		 834 aa  128  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  35.25 
 
 		 745 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  29.43 
 
 		 779 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  29.64 
 
 		 826 aa  117  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  31.1 
 
 		 762 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  30.33 
 
 		 719 aa  107  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  29.79 
 
 		 726 aa  89.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2539  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.73 
 
 		 228 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1262  hypothetical protein  40.91 
 
 		 228 aa  44.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5357  hypothetical protein  29.25 
 
 		 449 aa  44.3  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2679  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.76 
 
 		 228 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>