38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2470 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2470  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0836129 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  54.39 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  50.94 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  46.55 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  52.73 
 
 		 65 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1358  hypothetical protein  45.76 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  52.08 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  52.08 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  47.92 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  47.92 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  50.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1571  hypothetical protein  58 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.665593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  44.9 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0282  membrane protein  42.37 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  46.43 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2108  hypothetical protein  46.43 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.22897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3322  hypothetical protein  55 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443037  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1224  hypothetical protein  55 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  45.28 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1076  hypothetical protein  36.51 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000323708  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2025  hypothetical protein  53.66 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6998  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0554  hypothetical protein  32.84 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0552955 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0890  hypothetical protein  35.56 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>