13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1515 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1515  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1528    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5727  hypothetical protein  31.99 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6917  hypothetical protein  35.48 
 
 		 441 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1604  hypothetical protein  32.51 
 
 		 445 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6957  hypothetical protein  28.08 
 
 		 652 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5109  hypothetical protein  30.22 
 
 		 583 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 794 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 781 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 815 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  29.45 
 
 		 723 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1165  hypothetical protein  29.37 
 
 		 343 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181335  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3006  hypothetical protein  27.84 
 
 		 397 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41999  normal  0.506374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2364  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  44.3  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0996966  hitchhiker  0.00832001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>