14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0885 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03614  hypothetical protein  46.97 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.707311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3056  hypothetical protein  48.74 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3359  hypothetical protein  43.4 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4724  hypothetical protein  37.91 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0242073  normal  0.178225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2343  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  38.86 
 
 		 191 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  28.57 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.14 
 
 		 259 aa  49.7  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2448  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.07 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.03 
 
 		 254 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4015  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.03 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0118  putative HesA/moeB/thiF family protein  28.67 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  30.08 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.5 
 
 		 263 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>