32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0331 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  715    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  64.53 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  46.99 
 
 		 194 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  45.81 
 
 		 194 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  47.54 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  48.88 
 
 		 194 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  48.28 
 
 		 191 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  45.95 
 
 		 198 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  45.9 
 
 		 231 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  43.28 
 
 		 200 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  43.32 
 
 		 198 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  44 
 
 		 183 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  44 
 
 		 183 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  44.32 
 
 		 185 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  29.17 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2741  transport-associated protein  40.28 
 
 		 82 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.44364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0572  transport-associated  41.43 
 
 		 84 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  32.88 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  26.67 
 
 		 278 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  43.1 
 
 		 1977 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  38.57 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  38.57 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  31.82 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4674  cell surface protein  27.83 
 
 		 939 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0699989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1799  hypothetical protein  35.14 
 
 		 84 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3963  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166833  normal  0.240575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3583  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  28.97 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16860  putative phospholipid-binding protein  37.65 
 
 		 94 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.817215  normal  0.322334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>