20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0105 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0105  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  71.17 
 
 		 474 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  71.17 
 
 		 474 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  71.17 
 
 		 428 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  71.17 
 
 		 474 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  71.17 
 
 		 474 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  71.17 
 
 		 474 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3420  hypothetical protein  77.88 
 
 		 142 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  27.65 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  27.65 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  27.65 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  27.65 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  27.65 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  28.57 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  29.28 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  28 
 
 		 450 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  36.19 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2002  hypothetical protein  63.16 
 
 		 80 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.391718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  36.26 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  36.26 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>