16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0005 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00185715  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0022  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000777036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0015  tRNA-Met  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0015  tRNA-Met  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000205808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0031  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00193537  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0021  tRNA-Met  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0014  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65159  normal  0.954278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0043  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.538604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0058  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0028  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  85.29 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0012  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000647679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>