25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3987 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  338  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  39.43 
 
 
191 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  38.29 
 
 
192 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  37.43 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  36.84 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 
192 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  34.83 
 
 
193 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 
183 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  34.38 
 
 
195 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  33.14 
 
 
175 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  34.48 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  87.8  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  29.94 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  35.25 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  30.81 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  33.56 
 
 
793 aa  61.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  47.17 
 
 
179 aa  52  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  26.35 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  41.38 
 
 
141 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3009  hypothetical protein  38.33 
 
 
241 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>