30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1852 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1852  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00720  hypothetical protein  50.52 
 
 
388 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0263  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  41.18 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1744  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  41.34 
 
 
372 aa  319  5e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.311392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3062  formiminoglutamase-related protein  37.29 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0708  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.51 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.86 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  26.75 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  22.42 
 
 
325 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  25 
 
 
325 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  24.39 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.23 
 
 
316 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  23.77 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  23.77 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  20.79 
 
 
316 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  21.22 
 
 
345 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  21.22 
 
 
345 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  24.48 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  22.86 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  24.15 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  23.38 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  21.98 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.7 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  24.45 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  20.82 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  26.29 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.86 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  20.46 
 
 
354 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  22.16 
 
 
322 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  23.19 
 
 
279 aa  42.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>