42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3500 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3500  phage capsid scaffolding  100 
 
 
285 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.182545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4324  phage capsid scaffolding protein GpO  67.72 
 
 
284 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3051  phage capsid scaffolding protein GpO  67.02 
 
 
284 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.826647  hitchhiker  0.00000559875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4365  phage capsid scaffolding protein GpO  69.44 
 
 
287 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3172  capsid scaffolding  63.29 
 
 
284 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2328  capsid scaffolding  47.55 
 
 
271 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3049  phage capsid scaffolding protein  45.14 
 
 
277 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0925  phage capsid scaffolding protein  45.14 
 
 
277 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2867  phage capsid scaffolding protein  44.44 
 
 
277 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2776  capsid scaffolding  44.44 
 
 
277 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569535  decreased coverage  0.0000191582 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00842  hypothetical protein  49.37 
 
 
250 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00834  putative capsid scaffolding protein  49.37 
 
 
250 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2915  capsid scaffolding  45.26 
 
 
269 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1938  bacteriophage protein  39.07 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.168688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37600  Phage P2 capsid scaffolding gpO-like protein  43.1 
 
 
277 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1398  phage capsid scaffolding  43.46 
 
 
271 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4836  capsid scaffolding  41.9 
 
 
273 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01362  phage capsid scaffolding protein (GPO)  40.56 
 
 
280 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1351  Phage capsid scaffolding protein (GPO)  40.55 
 
 
269 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3290  phage capsid scaffolding  39.18 
 
 
306 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0206  capsid scaffolding  38.54 
 
 
272 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.134052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2642  capsid scaffolding  46.78 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.612438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3832  capsid scaffolding  38.71 
 
 
279 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1933  phage capsid scaffolding protein (GpO)  38.59 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.792365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1283  phage capsid scaffolding  44.37 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5053  scaffold  41.1 
 
 
381 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0703  scaffold  41.1 
 
 
381 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0696  phage capsid scaffolding  42.66 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1056  phage capsid scaffolding protein (GPO)  41.3 
 
 
299 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1027  phage capsid scaffolding protein  39.58 
 
 
291 aa  99  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1471  phage capsid scaffolding  37.76 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0721  phage capsid scaffolding  40.85 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2766  phage capsid scaffolding  37.76 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.752968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0586  hypothetical protein  39.13 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.689959 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05026  hypothetical protein  39.44 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0772  probable capsid scaffolding protein  35.76 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0240  capsid scaffolding  33.8 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0942  capsid scaffolding  35.66 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0898  putative capsid scaffolding protein  34.27 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2799  scaffold protein  28.46 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2935  phage capsid scaffolding  35.77 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67209e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3492  phage capsid scaffolding protein  27.97 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.41374e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>