33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1134 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1134  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 		 114 aa  226  9e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3528  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.17 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0591  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.46 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.96 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.85 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.91 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.7 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  30.77 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  29.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.72 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  28.57 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.53 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  28.57 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  28.57 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  28.57 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  28.57 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.75 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4062  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.68 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0283  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  35.16 
 
 		 101 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000385049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  31.87 
 
 		 102 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.27 
 
 		 125 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>