16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3523 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3523  fimbrial protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.244973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0145  fimbrial protein  70.41 
 
 		 196 aa  293  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.751304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3971  fimbrial protein  49.75 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0147  putative fimbrial protein  42.63 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0204  hypothetical protein  44.39 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646663  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3466  putative fimbrial protein  42.11 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00135  predicted fimbrial-like adhesin protein  42.63 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0140  hypothetical protein  42.63 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0281116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0139  hypothetical protein  42.63 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0206  putative fimbrial protein  39.22 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00134  hypothetical protein  41.28 
 
 		 120 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  27.46 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  27.46 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  27.46 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  27.46 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  26.94 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>