27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0038 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0223  5S ribosomal RNA  98.02 
 
 
101 bp  184  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.453534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0262  5S ribosomal RNA  97.96 
 
 
119 bp  89.7  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1082  5S ribosomal RNA  97.96 
 
 
119 bp  89.7  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.769106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0014  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 
114 bp  60  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0022  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 
114 bp  60  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0058  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 
114 bp  60  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0068  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 
114 bp  60  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 
117 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 
116 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 
116 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0051  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 
115 bp  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.205109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0005  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.247177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0022  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000398716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0027  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.733223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0054  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.238713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 
117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0050  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  normal  0.069231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
117 bp  44.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
117 bp  44.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>