42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4324 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4324  phage capsid scaffolding protein GpO  100 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3051  phage capsid scaffolding protein GpO  98.94 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.826647  hitchhiker  0.00000559875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3500  phage capsid scaffolding  67.72 
 
 		 285 aa  404  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.182545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3172  capsid scaffolding  69.82 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4365  phage capsid scaffolding protein GpO  62.37 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2328  capsid scaffolding  49.3 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2915  capsid scaffolding  48.24 
 
 		 269 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4836  capsid scaffolding  46.85 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2776  capsid scaffolding  45.64 
 
 		 277 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569535  decreased coverage  0.0000191582 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0925  phage capsid scaffolding protein  45.3 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3049  phage capsid scaffolding protein  44.95 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2867  phage capsid scaffolding protein  45.3 
 
 		 277 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0206  capsid scaffolding  44.76 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1938  bacteriophage protein  43.3 
 
 		 279 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.168688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1398  phage capsid scaffolding  45.7 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00842  hypothetical protein  47.66 
 
 		 250 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00834  putative capsid scaffolding protein  47.66 
 
 		 250 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37600  Phage P2 capsid scaffolding gpO-like protein  43.34 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01362  phage capsid scaffolding protein (GPO)  41.2 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1351  Phage capsid scaffolding protein (GPO)  42.41 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3290  phage capsid scaffolding  39.8 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2642  capsid scaffolding  39.36 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.612438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3832  capsid scaffolding  35.29 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1933  phage capsid scaffolding protein (GpO)  46.1 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.792365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1283  phage capsid scaffolding  45.33 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0696  phage capsid scaffolding  47.79 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0703  scaffold  33.21 
 
 		 381 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5053  scaffold  33.21 
 
 		 381 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1027  phage capsid scaffolding protein  44.29 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1056  phage capsid scaffolding protein (GPO)  44.68 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1471  phage capsid scaffolding  32.2 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2766  phage capsid scaffolding  32.82 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.752968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05026  hypothetical protein  40.28 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0586  hypothetical protein  36.88 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.689959 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0240  capsid scaffolding  30.99 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2799  scaffold protein  33.21 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0721  phage capsid scaffolding  41.54 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0942  capsid scaffolding  32.65 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3492  phage capsid scaffolding protein  29.46 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.41374e-21 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0772  probable capsid scaffolding protein  42.62 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0898  putative capsid scaffolding protein  28.93 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2935  phage capsid scaffolding  34.25 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.67209e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>