11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3121 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3121    100 
 
 		 808 bp  1602    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4722    98.61 
 
 		 882 bp  127  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  80.89 
 
 		 1485 bp  121  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03528    98.46 
 
 		 393 bp  113  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  79.93 
 
 		 1482 bp  107  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03478    100 
 
 		 366 bp  93.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.379725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0305  IS2 ORF2  97.87 
 
 		 366 bp  85.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  80.3 
 
 		 1428 bp  85.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  78.93 
 
 		 1485 bp  81.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  93.18 
 
 		 1407 bp  63.9  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  83.33 
 
 		 1395 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>