17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1971 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1971  pre-peptidase C-terminal domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1663  pre-peptidase C-terminal domain protein  99.25 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000320057  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01153  hypothetical protein  98.5 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01163  hypothetical protein  98.5 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0191677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2447  peptidase domain-containing protein  98.5 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1278  pre-peptidase C-terminal domain-containing protein  98.5 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000332318  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2470  peptidase domain protein  98.5 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00513747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1322  pre-peptidase C-terminal domain-containing protein  98.5 
 
 		 133 aa  266  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2817  pre-peptidase C- domain protein  79.7 
 
 		 133 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.153946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0465  hypothetical protein  33.61 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2032  Gifsy-1 prophage protein  30.56 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.867153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0742  Gifsy-1 prophage protein  29.63 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2388  hypothetical protein  30.3 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0089  Gifsy-1 prophage protein  32.46 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0064  putative hypothetical Gifsy-1 prophage protein  29.36 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.358866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1987  hypothetical protein  25.76 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2403  hypothetical protein  31.47 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.22531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>