13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2648 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2648  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.382598  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4672  conjugal transfer relaxosome component TraJ  53.04 
 
 		 124 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2250  conjugal transfer relaxosome component TraJ  53.57 
 
 		 117 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2539  conjugal transfer relaxosome component TraJ  55.45 
 
 		 123 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128505  hitchhiker  0.0000206935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15510  conjugal transfer relaxosome component TraJ  54.55 
 
 		 123 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.15987e-16  unclonable  4.24515e-22 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0027  conjugal transfer relaxosome component TraJ  48.62 
 
 		 118 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.88401e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4314  conjugal transfer relaxosome component TraJ  46.22 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0372  traJ protein  33.6 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0350  helix-turn-helix protein, CopG  34.45 
 
 		 118 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302097  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6527  conjugal transfer relaxosome component TraJ  46.79 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457965  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6610  conjugal transfer relaxosome component TraJ  46.79 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1092  mobilization protein MobB  39.47 
 
 		 104 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.12734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0269  putative plasmid conjugal transfer protein  30.77 
 
 		 107 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>