24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0542 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0542  hypothetical protein  100 
 
 
49 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0501  hypothetical protein  97.96 
 
 
49 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.263558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3311  hypothetical protein  73.33 
 
 
50 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.930689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3375  hypothetical protein  76.19 
 
 
46 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000276807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3693  hypothetical protein  76.19 
 
 
42 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4094  hypothetical protein  68.89 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0736  hypothetical protein  71.11 
 
 
57 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4788  hypothetical protein  66.67 
 
 
45 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0963  hypothetical protein  66.67 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4460  hypothetical protein  70.73 
 
 
49 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0131  enterobactin synthetase component D  66.67 
 
 
45 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168816  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4739  hypothetical protein  73.68 
 
 
45 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.662554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4423  hypothetical protein  73.68 
 
 
45 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0933  hypothetical protein  62.22 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0774  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  76.47 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538711  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4450  hypothetical protein  59.57 
 
 
47 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1966  hypothetical protein  66.67 
 
 
48 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2104  hypothetical protein  66.67 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0006  hypothetical protein  60 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4208  hypothetical protein  68.97 
 
 
33 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3911  hypothetical protein  68.97 
 
 
33 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.954869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0552  hypothetical protein  72 
 
 
46 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0588  hypothetical protein  75 
 
 
46 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0387  hypothetical protein  62.16 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.545968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>