21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0377 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0377  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.656327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3289  protein of unknown function DUF1097  98.79 
 
 		 165 aa  317  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3306  hypothetical protein  98.79 
 
 		 165 aa  317  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00276  hypothetical protein  98.79 
 
 		 165 aa  316  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00273  predicted inner membrane protein  98.79 
 
 		 165 aa  316  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.764997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0335  hypothetical protein  97.58 
 
 		 165 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0348  hypothetical protein  96.97 
 
 		 165 aa  308  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  29.7 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  29.09 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1605  hypothetical protein  30.12 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0476  hypothetical protein  26.35 
 
 		 170 aa  43.9  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160273  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0051  inner membrane protein  30.14 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1636  hypothetical protein  27.95 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5091  hypothetical protein  30.68 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135209  normal  0.26552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2235  inner membrane protein YcdZ  29.63 
 
 		 170 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800715 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1415  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0524852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1234  inner membrane protein YcdZ  29.63 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698042  normal  0.958349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1249  hypothetical protein  28.68 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.540058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1204  inner membrane protein YcdZ  29.63 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.541907  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2052  inner membrane protein YcdZ  28.68 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1471  membrane-fusion protein  27.59 
 
 		 400 aa  40.8  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>