9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2567 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02197    98.03 
 
 
461 bp  819    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.99349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  97.66 
 
 
972 bp  692    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  97.4 
 
 
972 bp  684    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2567    100 
 
 
639 bp  1267    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1378    98.25 
 
 
637 bp  1158    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.8736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  97.12 
 
 
822 bp  670    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3413    96.34 
 
 
381 bp  632  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666436  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02157    95.83 
 
 
375 bp  622  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.79851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2650    98.4 
 
 
369 bp  349  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.959493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>