16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1418 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1418  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1140  hypothetical protein  76.19 
 
 
63 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.506417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1252  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00282062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2283  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000794088  decreased coverage  2.9029200000000004e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2067  protein of unknown function DUF1482  66.67 
 
 
63 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2055  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0289214  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1746  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000344954  decreased coverage  0.0000110997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1782  hypothetical protein  65.08 
 
 
63 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.430243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01544  predicted protein  65.08 
 
 
63 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01536  hypothetical protein  65.08 
 
 
63 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000987506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1153  hypothetical protein  65.08 
 
 
63 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000165058  hitchhiker  1.09594e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2814  hypothetical protein  53.23 
 
 
62 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00286267  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2218  hypothetical protein  53.23 
 
 
62 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00125999  hitchhiker  4.64633e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0778  hypothetical protein  46.77 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000435757  hitchhiker  0.000897507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1823  hypothetical protein  56.1 
 
 
42 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000115799  hitchhiker  0.0000000000000162357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3176  hypothetical protein  56.1 
 
 
42 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187265  hitchhiker  4.99222e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>