23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2067 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2067  protein of unknown function DUF1482  100 
 
 		 63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0289214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1782  hypothetical protein  98.41 
 
 		 63 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.430243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01544  predicted protein  96.83 
 
 		 63 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01536  hypothetical protein  96.83 
 
 		 63 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000987506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1252  hypothetical protein  95.24 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00282062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2283  hypothetical protein  93.65 
 
 		 63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000794088  decreased coverage  2.9029200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1746  hypothetical protein  92.06 
 
 		 63 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000344954  decreased coverage  0.0000110997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1153  hypothetical protein  85.71 
 
 		 63 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000165058  hitchhiker  1.09594e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1140  hypothetical protein  63.49 
 
 		 63 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.506417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1418  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2814  hypothetical protein  46.77 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00286267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2218  hypothetical protein  45.16 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00125999  hitchhiker  4.64633e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0778  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000435757  hitchhiker  0.000897507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2105  hypothetical protein  36.07 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0609353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1805  protein of unknown function DUF1482  36.07 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2570  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.602655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01796  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1350  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.149922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2066  hypothetical protein  36.07 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01808  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1795  hypothetical protein  36.07 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2407  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>