21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0539 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0539    100 
 
 		 372 bp  737    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  100 
 
 		 372 bp  737    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0603    99.73 
 
 		 372 bp  729    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0436    99.73 
 
 		 372 bp  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.115653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 372 bp  737    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 372 bp  737    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0025    98.05 
 
 		 216 bp  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  87.16 
 
 		 1041 bp  105  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  87.16 
 
 		 1041 bp  105  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  87.16 
 
 		 1041 bp  105  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  87.16 
 
 		 1041 bp  105  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  87.16 
 
 		 1041 bp  105  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  85.59 
 
 		 1041 bp  93.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0914    85.59 
 
 		 2410 bp  93.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  85.59 
 
 		 1041 bp  93.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  85.59 
 
 		 1041 bp  93.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  85.59 
 
 		 1041 bp  93.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  82.79 
 
 		 1041 bp  75.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  82.79 
 
 		 192 bp  75.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  86.76 
 
 		 468 bp  63.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4574    86.76 
 
 		 480 bp  63.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176839  normal  0.479872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>