59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2768 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2768  protein of unknown function DUF340 membrane  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00879  predicted transporter  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0947  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00885  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0978  hypothetical protein  99.33 
 
 		 299 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1035  hypothetical protein  99.67 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2722  protein of unknown function DUF340 membrane  99.33 
 
 		 299 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0903  hypothetical protein  98.66 
 
 		 299 aa  577  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.469991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2457  hypothetical protein  99.67 
 
 		 299 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.98715  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0973  hypothetical protein  88.63 
 
 		 299 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1056  hypothetical protein  88.96 
 
 		 299 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0939  hypothetical protein  88.96 
 
 		 299 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1005  hypothetical protein  88.96 
 
 		 299 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.85615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1036  hypothetical protein  88.29 
 
 		 299 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1391  protein of unknown function DUF340, membrane  84.95 
 
 		 299 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2700  protein of unknown function DUF340 membrane  71.81 
 
 		 298 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1592  hypothetical protein  71.81 
 
 		 298 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2616  hypothetical protein  71.81 
 
 		 298 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1667  protein of unknown function DUF340 membrane  70.47 
 
 		 298 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104731  normal  0.791329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1708  hypothetical protein  63.88 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1974  protein of unknown function DUF340 membrane  63.33 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003756  membrane protein  53.54 
 
 		 301 aa  290  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02630  hypothetical protein  52.53 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0721  hypothetical protein  52.53 
 
 		 301 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0906  permease  47.33 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0657608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0928  protein of unknown function DUF340, membrane  47.81 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.726506  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0598  protein of unknown function DUF340, membrane  39 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1966  protein of unknown function DUF340, membrane  40.2 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2034  membrane protein  47.56 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0630  hypothetical protein  37.67 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0847  protein of unknown function DUF340 membrane  38.78 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3666  protein of unknown function DUF340, membrane  40.2 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0355  protein of unknown function DUF340 membrane  39.01 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2478  protein of unknown function DUF340 membrane  28.71 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1190  protein of unknown function DUF340 membrane  36.69 
 
 		 193 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1787  protein of unknown function DUF340 membrane  33.22 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  normal  0.778551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2328  protein of unknown function DUF340, membrane  35.6 
 
 		 200 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0324  protein of unknown function DUF340 membrane  37.04 
 
 		 195 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0202278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07210  predicted membrane protein  29.15 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000277975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1313  protein of unknown function DUF340 membrane  35.98 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1134  protein of unknown function DUF340, membrane  34.92 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0595  protein of unknown function DUF340, membrane  42.73 
 
 		 195 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.636868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0241  protein of unknown function DUF340 membrane  41.07 
 
 		 195 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1660  protein of unknown function DUF340 membrane  35.14 
 
 		 195 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.429066  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0144  protein of unknown function DUF340 membrane  32.24 
 
 		 199 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1843  protein of unknown function DUF340 membrane  33.96 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0859  protein of unknown function DUF340 membrane  31.95 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.502969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2305  hypothetical protein  32.52 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0718  protein of unknown function DUF340, membrane  25.59 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0050  protein of unknown function DUF340 membrane  34.07 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3085  protein of unknown function DUF340 membrane  27.38 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.643763  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1394  protein of unknown function DUF340 membrane  27.56 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000734675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1823  protein of unknown function DUF340, membrane  32.93 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21000  predicted membrane protein  27.52 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1574  protein of unknown function DUF340, membrane  30.13 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2905  protein of unknown function DUF340 membrane  37.37 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0812  protein of unknown function DUF340, membrane  36.7 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0605  protein of unknown function DUF340 membrane  32.72 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0612  protein of unknown function DUF340, membrane  35.71 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.454332  normal  0.780687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>