25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0223 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0223  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 101 bp  200  5e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.453534  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0038  5S ribosomal RNA  98.02 
 
 		 120 bp  184  3e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0262  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 119 bp  54  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1082  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 119 bp  54  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.769106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0014  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0022  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0058  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0068  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0054  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.238713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0027  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.733223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0022  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000398716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0005  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.247177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>