49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5082 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  34.69 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  34.15 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  34.15 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  34.29 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  34.29 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  31.9 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  31.9 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  31.9 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  31.9 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  31.9 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  31.54 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  31.23 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  31.54 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  30.77 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  30.6 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  29.07 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  28.45 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  31.36 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  30.93 
 
 		 300 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  30 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  31.91 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  29.11 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  30.93 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  29.57 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  28.69 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  28.45 
 
 		 326 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  28.57 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  26.55 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  27.78 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  26.18 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  26.18 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  28.32 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  28 
 
 		 329 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  28.9 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  27.75 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  26.03 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  26.22 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  27.27 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  26.09 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  25.65 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  25 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  25.65 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  24.52 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  22.53 
 
 		 751 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  26.17 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2866  hypothetical protein  24.1 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>