14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4769 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4769  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3734  hypothetical protein  97.18 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1540  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1662  tetratricopeptide TPR_4  30.21 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.399527  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0994  hypothetical protein  32.2 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0924  Tetratricopeptide TPR_4  30.67 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638112  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0859  Tetratricopeptide TPR_4  30.25 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0665  tetratricopeptide TPR_4  26.32 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1986  putative transmembrane protein  26.97 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2498  hypothetical protein  30.58 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0034451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0637  tetratricopeptide TPR_4  25.86 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 761 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 620 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 254 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>