9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3413 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02197    99.13 
 
 		 461 bp  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.99349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3413    100 
 
 		 381 bp  755    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02157    97.11 
 
 		 375 bp  672    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.79851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2567    96.34 
 
 		 639 bp  632  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1378    95.3 
 
 		 637 bp  601  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.8736 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  95.04 
 
 		 972 bp  593  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  94.78 
 
 		 972 bp  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  93.95 
 
 		 822 bp  555  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2650    98.4 
 
 		 369 bp  349  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.959493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>