34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_R0008 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210448 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4572  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000682737  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0217  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000698181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0784  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5814  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5731  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5638  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.114187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5029  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4998  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0859  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0100  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0103  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000553911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0138  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00946878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5693  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000772735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0023  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0238053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000205761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000281686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5727  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000902982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>