45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2527 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  67.88 
 
 
168 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  75.86 
 
 
173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  58.11 
 
 
166 aa  164  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  44.52 
 
 
156 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  31.82 
 
 
146 aa  87.8  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  28.47 
 
 
142 aa  86.3  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  32.8 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  32.8 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  32.35 
 
 
156 aa  82  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  35.11 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  30.71 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  28.87 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  29.29 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  30.94 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  29.29 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  31.11 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  28.12 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  34.43 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  30.07 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  29.2 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  28.06 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  26.9 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  26.09 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  39.84 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  27.33 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  27.97 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  35.78 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  36.28 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  26.35 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  31.5 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  34.96 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  30.19 
 
 
156 aa  60.8  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  26.81 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  25.19 
 
 
130 aa  56.6  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  32.38 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 
135 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  32.2 
 
 
135 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0210  protein of unknown function DUF180  32.43 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.945041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  29.66 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  27.19 
 
 
131 aa  51.6  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  25.83 
 
 
154 aa  47.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  24.32 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  32.08 
 
 
136 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>