22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3509 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  157  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  84.72 
 
 		 72 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1315  hypothetical protein  77.33 
 
 		 75 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2642  hypothetical protein  73.68 
 
 		 76 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  55.88 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2702  putative lipoprotein  86.27 
 
 		 51 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  48.72 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  46.15 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  44.87 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  46.15 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  49.32 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  45.21 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1337  hypothetical protein  44.3 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0469662  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0723  putative lipoprotein  54.05 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  50.68 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  47.95 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  47.95 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  47.14 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  41.1 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  52.05 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>