20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4010 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4010  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1950  hypothetical protein  41.71 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1939  hypothetical protein  40.76 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1746  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0623584  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4937  hypothetical protein  39 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0942903  normal  0.32552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4717  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.75 
 
 		 101 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.649718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1096  hypothetical protein  36.27 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2300  hypothetical protein  37.25 
 
 		 103 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3597  hypothetical protein  44.21 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0220403  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0229  hypothetical protein  40.54 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00650925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4025  hypothetical protein  35.29 
 
 		 99 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1052  hypothetical protein  34 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00452566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1983  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1383  hypothetical protein  39.47 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5651  hypothetical protein  41.79 
 
 		 100 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1179  hypothetical protein  41.79 
 
 		 100 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.933496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4409  hypothetical protein  40.48 
 
 		 98 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0965  hypothetical protein  38.24 
 
 		 101 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00474357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5400  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0915  hypothetical protein  34.78 
 
 		 100 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>