18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3850 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3850  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0876589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  67.86 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3807  hypothetical protein  57.14 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  59.04 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  58.62 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0262  hypothetical protein  58.54 
 
 		 93 aa  90.5  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.623777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0085  hypothetical protein  51.76 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  55 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3369  hypothetical protein  54.43 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16910  hypothetical protein  57.65 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331531  normal  0.123249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0296  hypothetical protein  50.62 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0873  hypothetical protein  50.6 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1565  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.679201  hitchhiker  0.00228497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3839  hypothetical protein  52.44 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4747  hypothetical protein  48.75 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1968  hypothetical protein  46.25 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128383  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  61.29 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4990  hypothetical protein  40.62 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604608  normal  0.264456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>