30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3290 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3290  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0085  hypothetical protein  56.62 
 
 		 138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0846  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0558  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0561  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280356  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5555  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  0.83803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0194216  hitchhiker  0.00758205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2842  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0564  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.83 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000336397  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  37.3 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0444  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.61 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2591  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 139 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.61 
 
 		 131 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1233  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0637718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116705 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6483  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1424  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.805233  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3967  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3472  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.404559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7202  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.32 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4027  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3001  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3444  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2320  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 		 159 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>