46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2648 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  158  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  86.25 
 
 		 87 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  85 
 
 		 82 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  85 
 
 		 82 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  86.08 
 
 		 82 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  86.08 
 
 		 79 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  67.5 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  70.13 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  60.53 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  56.41 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  56.41 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  60 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  58.67 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  55.13 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  53.85 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  55.13 
 
 		 85 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  49.37 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  55.84 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  50.63 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  49.37 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  51.28 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  52.56 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  53.95 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  54.67 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  50 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  52.63 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  52.63 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  46.75 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  44.3 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  48.05 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  50.67 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  57.14 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  51.32 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  36.92 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  34.88 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  46.75 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  41.56 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  34.67 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  34.15 
 
 		 85 aa  42  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0304  hypothetical protein  44.23 
 
 		 86 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  33.75 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0051  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461056  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  36.84 
 
 		 83 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>