37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2299 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2299  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1236  hypothetical protein  49.68 
 
 
156 aa  160  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2830  HAD family hydrolase  51.61 
 
 
156 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1112  hypothetical protein  47.1 
 
 
156 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00144751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1135  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0282  hypothetical protein  45.51 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1184  hypothetical protein  45.81 
 
 
156 aa  133  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1711  hypothetical protein  47.33 
 
 
155 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0027  hypothetical protein  41.94 
 
 
156 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25270  soluble P-type ATPase  43.23 
 
 
154 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0968329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0593  hypothetical protein  43.95 
 
 
158 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1047  hypothetical protein  45.16 
 
 
156 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1180  hypothetical protein  45.16 
 
 
156 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0830  soluble P-type ATPase  41.29 
 
 
156 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0424  hypothetical protein  45.28 
 
 
160 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0477  HAD family hydrolase  39.1 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0341937  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0725  HAD family hydrolase  40.13 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1442  HAD family hydrolase  41.04 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0360  hypothetical protein  41.22 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.171021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0545  HAD family hydrolase  41.03 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0908352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  30.47 
 
 
744 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 
799 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  32.12 
 
 
698 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 
799 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3660  ATPase P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  39.29 
 
 
839 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559145  normal  0.48844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3064  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  37.04 
 
 
931 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  33.09 
 
 
792 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2379  heavy metal translocating P-type ATPase  31.54 
 
 
752 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000287597  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0565  hypothetical protein  34.62 
 
 
896 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  30.37 
 
 
800 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  33.08 
 
 
797 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0812  magnesium-transporting ATPase E1-E2 family protein  45.9 
 
 
911 aa  41.6  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0193  copper-transporting P-type ATPase  28.79 
 
 
709 aa  41.2  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0946171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  32.29 
 
 
791 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1354  cation transport ATPase  46.88 
 
 
906 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  33.08 
 
 
799 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  32.35 
 
 
792 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>