44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0749 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0749  putative PhnB protein  100 
 
 
40 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.905372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2231  hypothetical protein  67.57 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2515  hypothetical protein  64.86 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2898  hypothetical protein  62.16 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  normal  0.0303776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2438  hypothetical protein  62.16 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2580  hypothetical protein  64.86 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2290  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  64.86 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000395035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  61.11 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2309  hypothetical protein  64.86 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000699699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2277  hypothetical protein  64.86 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.9839499999999997e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2484  hypothetical protein  64.86 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000939903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3115  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  61.11 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.358222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2505  hypothetical protein  62.16 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4095  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  51.35 
 
 
297 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450516  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  55.26 
 
 
313 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0212284  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1524  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  52.78 
 
 
305 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2751  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  54.05 
 
 
306 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000131206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2291  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  51.35 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0826  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  60 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1478  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  58.33 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.470601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1566  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  55.56 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2584  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.91802  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  55.56 
 
 
131 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.128238  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2302  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  56.25 
 
 
298 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.640277  normal  0.0360372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2669  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.57 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0901149  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2105  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  54.29 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.20151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1353  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.44 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.210501  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4025  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46720  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00497618  hitchhiker  0.000000386727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3853  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  52.63 
 
 
294 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.245604  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  51.28 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1180  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  52.94 
 
 
280 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.386198  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.03 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3001  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.22 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2043  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  45.95 
 
 
164 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1646  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.65 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.123315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02340  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.57 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1291  hypothetical protein  48.57 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1266  hypothetical protein  48.57 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.910591  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31410  hypothetical protein  43.59 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4170  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.22 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1560  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.84 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0774  hypothetical protein  48.57 
 
 
135 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>