21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3167 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  276  8e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  67.41 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  51.52 
 
 		 134 aa  153  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  54.2 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  50.75 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  48.09 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  45.8 
 
 		 135 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  36.92 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  34.35 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  38.17 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  34.81 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  29.01 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  30.77 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  27.69 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  28.76 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3956  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.104147  normal  0.970496 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  26.97 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2539  hypothetical protein  38.98 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00977355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>